ここでは、生物のアミノ酸系列の整列化に適用した例を取り上げます。
生物はいろいろなタンパク質から作られており、それらのタンパク質はすべて20種類のアミノ酸の有限列で構成されていることが知られています。
ところで、同じタンパク質でも生物の種が違うとアミノ酸系列が異なります。たとえばチトクロムCというタンパク質のアミノ酸系列は、構成も長さも違います。しかし、よく見ると所々に同じ部分系列が含まれています。
ここではヒトのアミノ酸系列とジャガイモ、ミドリムシ、クロバエ、ウサギなどのアミノ酸系列を比較してみます。
実行
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